国家蛋白质科学研究设施引入AI技术支持相关研究蛋白质设施正在引入国产自主可控的高性能分子动力学模拟计算平台，以支撑相关科研。
界面新闻记者 |
界面新闻编辑 | 庄键
7月26日，中国科学院上海高等研究院举办“国家蛋白质科学研究（上海）设施开放十周年学术论坛”。会上透露，国家蛋白质科学研究（上海）设施（下称蛋白质设施）正在引入国产自主可控的高性能分子动力学模拟计算平台，以支撑相关科研。
蛋白质设施隶属于中国科学院上海高等研究院，坐落在上海张江，由国家发展改革委员会投资并于2010年12月26日开工建设，2015年7月28日通过国家验收正式开放运行。
作为全球首个生命科学领域的综合性大科学装置，蛋白质设施现有九大技术系统，建立了从蛋白质样品制备、结构解析到功能研究的完整技术体系。
截至目前，蛋白质设施已服务全国33个省级行政区的504家科研单位（含100多家科技企业），支撑超过2500个研究团队、累计10万余人次用户开展实验研究。设施支撑完成科研课题超13400项。截至2025年5月31日，蛋白质设施已经为107家企业提供技术支撑和服务。2024年全年产业用户机时1670小时，产业用户服务量逐年增加。
比如，蛋白质设施与美国赛默飞公司达成战略合作“蛋白质动态分析联合实验室”，基于赛默飞全球领先的高分辨质谱、冷冻电镜等平台及蛋白质组学解决方案，与德国布鲁克公司合作共建“生物核磁技术开发与用户服务中心”，在设备升级、技术创新、产品展示、用户培训和学术交流等方面开展深入合作。
据透露，蛋白质设施多个技术系统为100多家生物医药产业公司提供完备的生物医药研发技术支持。
其中，设施现已支持百济神州完成了国产抗癌药“泽布替尼”关键靶点的结构优化研究，助力其在中美两地同步上市；支持复星凯特、信达生物、睿智化学等多家企业开展PD-1抗体药物、mRNA核酸药物、抗体偶联药物等方向的关键技术攻关。
目前，蛋白质设施已为超过100家生物医药企业提供高端技术服务，覆盖抗体工程、结构疫苗、细胞治疗、药物递送系统、合成生物学等领域。
面向人工智能时代的深度演进，科学研究正步入以数据驱动和模型预测为特征的“AI for Science（人工智能驱动科学研究）”新时代。
此前，蛋白质设施与上海科技大学iHuman研究所、免疫化学研究所联合建设“中国蛋白质结构数据库”（PDBc），并于2022年正式加入国际蛋白质结构数据库组织，成为全球第四个国家和地区成员。
近期，蛋白质设施与上海思朗万维计算技术有限公司共建“高性能蛋白质动态计算中心”，引入国产自主可控的高性能分子动力学模拟计算平台，通过“AI建模+实验验证+动态结构还原”的融合式研究支撑蛋白质动态机制解析、活性构象识别、靶点结构变构预测等复杂任务，为新药发现与功能蛋白设计奠定数据基础。
蛋白质设施将对PDBc数据库与计算框架进行升级，并携手康码（上海）生物科技有限公司，联合打造全球首个高通量的“DNA-to-Protein蛋白质体外无细胞合成”智能制造装置。
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